Em Configurações › Entrega, escolha Por cidade na pergunta Como calcular a taxa de entrega?. Cada cidade que você atende ganha o seu próprio valor de entrega.

Abra Configurações › Entrega.
Escolha Por cidade.
Em Áreas e taxas, selecione o Estado e depois a Cidade.
Preencha Taxa para aquela cidade.
Preencha Repasse ao entregador, se você paga por zona.
Salve. Aparece Zonas de entrega salvas!.

Repita para cada cidade. As já cadastradas ficam listadas em Cidades atendidas.

Quando esse modo compensa

Cidade cadastrada é cidade atendida

Só quem mora em uma cidade da lista consegue fechar o pedido com entrega. Cidade que não está em Cidades atendidas fica de fora da sua área.

Trocar de modo depois

Mudar a resposta de Como calcular a taxa de entrega? salva a escolha na hora. As taxas que você já cadastrou continuam guardadas, então voltar para Por cidade mais tarde não faz você digitar tudo de novo.

Quem pode fazer isso

Proprietário e Gerente.